238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0120 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0120  LemA family protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000229196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  37.14 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  41.36 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  35.91 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  34.52 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  34.73 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.14 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  32.95 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  35.19 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  32.02 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  32.02 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  32.57 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  31.82 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  36.65 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  33.88 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  36.02 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  34.62 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  32.22 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  32.32 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  33.93 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  29.28 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  35 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  34.9 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  29.19 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  30.77 
 
 		 249 aa  97.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  33.92 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  31.14 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  29.94 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  29.38 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  31.87 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  31.25 
 
 		 195 aa  94  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  31.91 
 
 		 217 aa  94.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  28.05 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  28.42 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  31.87 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  32.3 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.24 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  29.84 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2465  LemA family protein  31.1 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  28.72 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  25.84 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  31.29 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  28.5 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  28.89 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  27.27 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  35.92 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.06 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  28.22 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  24.86 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  31.98 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  26.49 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  28.02 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  30.16 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  26.67 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  30.99 
 
 		 185 aa  85.1  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  31.65 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  30.18 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  28.4 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  30.81 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  26.09 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  27.22 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  27.81 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  29.38 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  31.25 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  29.27 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  28.4 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  28.74 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  28.25 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  28.32 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  29.38 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  30.49 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  32.47 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  29.61 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  27.62 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  28.88 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  29.22 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  29.38 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  29.45 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  29.38 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  29.38 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  30.72 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  24.44 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  29.02 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  28.65 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  29.82 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  28.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  27.95 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  28.02 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  28.02 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  29.79 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>