241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3325 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  82.01 
 
 		 190 aa  317  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  63.16 
 
 		 191 aa  252  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  62.5 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  60.32 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  63.49 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  48.07 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.76 
 
 		 183 aa  150  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.61 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.71 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.96 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  44.91 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.34 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.71 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  44.51 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  44.77 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  45.34 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  44.58 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  43.71 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  43.86 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  42.6 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  43.24 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  44.72 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  41.62 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  40.83 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  43.04 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  42.37 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  43.79 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  41.76 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  41.98 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  41.14 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  40.96 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  39.13 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  38.67 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  39.18 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40.99 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.31 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  45.1 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  41.33 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  40.22 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  39.78 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  39.36 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  45.06 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  44.9 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  39.02 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  42.77 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  37.43 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  34.78 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  38.75 
 
 		 249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  39.77 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  40 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  39.08 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  37.71 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  37.42 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.71 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.71 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  34.76 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  42.47 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  42.47 
 
 		 208 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  38.18 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  39.41 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  41.78 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  36.25 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  33.15 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.88 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  36.97 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  33.15 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  38.32 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  34.92 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.88 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  36.69 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.95 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  36.42 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  35.93 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  41.21 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  43.87 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  35.93 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  35.8 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  39.31 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  35.29 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  35.48 
 
 		 437 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  36.02 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  43.42 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  35.76 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  42.76 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  37.09 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  32.14 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  36.75 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  32.45 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  30 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  35 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  34.1 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  32.28 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  32.92 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  32.04 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>