233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  35.03 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.29 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.23 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  39.08 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  33.88 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  34.76 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  30.46 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  33.12 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  32.77 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  29.94 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  37.87 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  32.75 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.33 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  35.09 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  35.8 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  34.27 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  32.18 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  30.85 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  33.52 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  36.69 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  33.77 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  35.75 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  37.13 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  31.18 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  31.18 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  31.18 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  34.57 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  31.03 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  35.75 
 
 		 190 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  33.53 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  31.74 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  33.53 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  29.35 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  29.35 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  29.35 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  29.83 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  34.69 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0332  LemA family  29.38 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  29.38 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  28.8 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  31.55 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  30.36 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  31.33 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  30.73 
 
 		 434 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  31.95 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  33.51 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  32.16 
 
 		 433 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  33.13 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  32.08 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  30.54 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  30.85 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  33.55 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  34.93 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  32.16 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  31.4 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  38.92 
 
 		 437 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  32.05 
 
 		 434 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  32.24 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  27.96 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  31.91 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.22 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  33.71 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  32.02 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  27.43 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  33.12 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  31.18 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  32.24 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  26.7 
 
 		 189 aa  84.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  30 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  31.84 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  30.86 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  26.74 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  33.56 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  30.34 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  29.94 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  26.35 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  33.33 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  28.65 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  29.09 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  25.29 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  31.68 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  32.92 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  32.26 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  29.28 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  28.4 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  31.69 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>