243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4056 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  83.51 
 
 		 189 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  81.48 
 
 		 189 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  75.53 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  78.98 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  76.6 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  76.6 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  75.53 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  75.53 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  75.53 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  76.6 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  77.71 
 
 		 189 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0095  LemA family protein  55.85 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  34.43 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  43.87 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  36.26 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  40.35 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  35.03 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  36.78 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  37.8 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  35.63 
 
 		 183 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  35.67 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  33.7 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  34.48 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.79 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  33.91 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  36.31 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  35.96 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3606  hypothetical protein  33.7 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  35.14 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  33.14 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  31.67 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  36.91 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  31.49 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  33.12 
 
 		 249 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  35.03 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  31.28 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  33.14 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  33.72 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  33.72 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  34.46 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  33.72 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  37.24 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  32.74 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  32.78 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  33.97 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  31.65 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  30.22 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  32.72 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  30.25 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  31.58 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  32.48 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  36.24 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  31.06 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  29.57 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  30.99 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  31.48 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  35.17 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  29.9 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  36.54 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  33.12 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.12 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  32 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  28.65 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  29.81 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2848  LemA family protein  33.56 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0119025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  29.81 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  29.81 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  30.64 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  28.02 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  31.48 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  33.13 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  32.32 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  28.29 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  28.29 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  30.57 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  32.52 
 
 		 434 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  32.88 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  31.97 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  29.82 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  31.55 
 
 		 434 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  32.28 
 
 		 433 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  32.21 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  35.2 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  30.56 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  31.37 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  27.38 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  31.94 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  30.18 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  29.65 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  30.61 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  30.13 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  26.14 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>