254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_117 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  88.25 
 
 		 433 aa  763    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  100 
 
 		 434 aa  896    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  87.56 
 
 		 434 aa  759    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  47.92 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  41.52 
 
 		 188 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.04 
 
 		 181 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  43.48 
 
 		 183 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  41.4 
 
 		 195 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  40.51 
 
 		 199 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  37.02 
 
 		 201 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.14 
 
 		 188 aa  127  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  43.67 
 
 		 189 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  41.06 
 
 		 188 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  36.46 
 
 		 201 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.88 
 
 		 184 aa  124  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  39.66 
 
 		 196 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  41.22 
 
 		 185 aa  120  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  37.1 
 
 		 192 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  37.43 
 
 		 183 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  39.51 
 
 		 182 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  37.28 
 
 		 186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  43.21 
 
 		 185 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  41.46 
 
 		 188 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  40.74 
 
 		 184 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  38.6 
 
 		 195 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  37.82 
 
 		 196 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  35.63 
 
 		 198 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  39.88 
 
 		 186 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  38.96 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  36.63 
 
 		 192 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  38.89 
 
 		 186 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  37.97 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  35.59 
 
 		 185 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  36.21 
 
 		 183 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  40.26 
 
 		 194 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  40.67 
 
 		 208 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  40.67 
 
 		 187 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  34.72 
 
 		 196 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  38.59 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  38.41 
 
 		 185 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  36.46 
 
 		 185 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  34.91 
 
 		 189 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  31.91 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  37.58 
 
 		 196 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  33.72 
 
 		 186 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  41.72 
 
 		 193 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  31.55 
 
 		 197 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  36.71 
 
 		 198 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  39.05 
 
 		 186 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  34.5 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  34.88 
 
 		 188 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  34.86 
 
 		 183 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  34.13 
 
 		 184 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  37.89 
 
 		 187 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  34.86 
 
 		 183 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  35.33 
 
 		 189 aa  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  39.35 
 
 		 193 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  39.35 
 
 		 193 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  37.33 
 
 		 186 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  38.75 
 
 		 187 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  34.64 
 
 		 196 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  37.13 
 
 		 183 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  35.76 
 
 		 187 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  37.65 
 
 		 184 aa  99.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  37.34 
 
 		 189 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  33.71 
 
 		 193 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  34.95 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  36.53 
 
 		 183 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  37.42 
 
 		 187 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  37.06 
 
 		 181 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  35.63 
 
 		 180 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  35.63 
 
 		 180 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  36.24 
 
 		 195 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  35.06 
 
 		 180 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  33.33 
 
 		 202 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  37.25 
 
 		 194 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  35.47 
 
 		 244 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  34.16 
 
 		 182 aa  96.3  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  35.06 
 
 		 189 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  33.71 
 
 		 188 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  32.07 
 
 		 193 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  33.53 
 
 		 188 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.9 
 
 		 187 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  33.53 
 
 		 188 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  32.37 
 
 		 180 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  33.53 
 
 		 188 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  32.76 
 
 		 189 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  36.02 
 
 		 201 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  32.52 
 
 		 180 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  34.71 
 
 		 182 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  34.52 
 
 		 192 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  32.18 
 
 		 189 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  35.22 
 
 		 180 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  33.53 
 
 		 210 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  32.57 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  32.57 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  32.57 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  33.53 
 
 		 210 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  35.8 
 
 		 185 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>