237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1882 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  50 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  38.38 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  39.76 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  41.67 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  39.18 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  35.63 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.67 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  36.72 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  35.85 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  34.09 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  34.09 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  34.36 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  31.91 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  32.74 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  30.68 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  34.94 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  34.5 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  31.1 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  36.42 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  32.04 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  38 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  32.75 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  36.42 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  36.72 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  31.91 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  31.91 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  31.91 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  36.05 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  38.1 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  37.11 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  34.59 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  34.59 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  35.22 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  32.76 
 
 		 201 aa  98.2  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  33.75 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  34.59 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  34.59 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  30.86 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  32.18 
 
 		 201 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  32.34 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  32.5 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  35.67 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  32.14 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  31.82 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  33.97 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  28.92 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  30.32 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  30.32 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  30.32 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  30.06 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  29.27 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  35.53 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  32.39 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  35.14 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  28.66 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  32.21 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  31.1 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  31.68 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  31.01 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  29.88 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  31.22 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  32.69 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.1 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  27.87 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  31.74 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  29.19 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  32.37 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  31.93 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  28.04 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  29.31 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  28.16 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  31.17 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  31.97 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  31.97 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  31.33 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  31.17 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  25.41 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  28.32 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  32.35 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  32.92 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  29.34 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.67 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  28.9 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  30.86 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  25.6 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  33.33 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  30.19 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  30.3 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>