243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3560 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  77.66 
 
 		 188 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  80.95 
 
 		 189 aa  309  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  77.66 
 
 		 188 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  77.66 
 
 		 188 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  77.66 
 
 		 188 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  76.06 
 
 		 188 aa  308  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  76.06 
 
 		 188 aa  308  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  76.06 
 
 		 188 aa  308  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  76.72 
 
 		 189 aa  305  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  78.41 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  76.84 
 
 		 189 aa  295  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0095  LemA family protein  53.72 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  38.59 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  40.35 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  39.78 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  32.97 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  39.39 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  38.2 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  34.5 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  37.5 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  37.87 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  36.81 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  37.28 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  36.67 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  36.69 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.08 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.08 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  33.91 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  32.6 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  37.28 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  35.88 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  36.81 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  34.12 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  34.9 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  36.08 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  37.82 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  36.36 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  34.78 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  38.27 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  35.22 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  34.68 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  33.33 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  34.52 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  33.52 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  35.19 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  28.34 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  37.11 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  35.09 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  37.11 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  34.64 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  31.93 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3606  hypothetical protein  32.39 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  30.23 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  33.54 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  32.69 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  30.48 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  37.13 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  31.84 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  35.06 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  32.14 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  31.43 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  30.86 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  34.16 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  30.25 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  34.9 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.03 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  32.1 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  36.14 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  34.15 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  31.18 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  31.28 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  31.45 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  29.81 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  34.27 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  32.95 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  30.16 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  30.82 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  30.99 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.9 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  28.98 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  32.16 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  28.42 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  31.32 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  28.43 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  29.95 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  31.52 
 
 		 434 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  28.96 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  33.55 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  30.9 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  33.74 
 
 		 434 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  27.95 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  29.52 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  30.27 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  30 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>