239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1229 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  41.42 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  38.98 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  39.11 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  40.88 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  38.07 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  40.24 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42.11 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  40.76 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.72 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  39.26 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  36.97 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  37.28 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  36.46 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  36.69 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  37.35 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  37.89 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  39.63 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  33.75 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  39.52 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  36.42 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  34.91 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  36.78 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  36.54 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  34.94 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  35.8 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  35.5 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  34.91 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  40.4 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  32.3 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  35.19 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  32.95 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  33.13 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  34.52 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  33.75 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  33.7 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  32.76 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  34.36 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  36.48 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  34.32 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  32.42 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  36.26 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  33.53 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  29.55 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  34.81 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  29.55 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  30.17 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  30.17 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  30.17 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  32.1 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  33.33 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  31.25 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  29.61 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  33.77 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  35.03 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  32.35 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  32.67 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  32.96 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  33.77 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  33.52 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  33.73 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  32.69 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  32.96 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  32.96 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  32.96 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  32.96 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  32.96 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  31.32 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  31.76 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  30.54 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  34.39 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  35.92 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  31.21 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  30.06 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  35.71 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  31.22 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  34.13 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  31.68 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  29.44 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  32.32 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  31.98 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  33.55 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  30.48 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  31.68 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  29.81 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  32.43 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  28.49 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  29.61 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  32.3 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  34.62 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.18 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  28.5 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  32.43 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  30.97 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  31.68 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  28.48 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>