241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  82.01 
 
 		 190 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  71.68 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  61.58 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  61.05 
 
 		 191 aa  238  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  65.7 
 
 		 188 aa  237  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  48.6 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  46.28 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  44.38 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  48.81 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.78 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  45.99 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.75 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  46.2 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  44.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  47.02 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  45.03 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.25 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  44.81 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.76 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  43.67 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  44.44 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.59 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  43.79 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  44.97 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  41.1 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.67 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.99 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.86 
 
 		 186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  42.17 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  39.64 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  40.51 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  43.33 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  43.37 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  39.89 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  45.1 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.52 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40.37 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  37.65 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  40.68 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.11 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  42.16 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  40.67 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  42.5 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  40.74 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  38.32 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42.94 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  35.83 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  39.78 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  39.75 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  39.11 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  44.14 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  40.13 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  37.87 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  34.25 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.59 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  35.62 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  36.14 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.2 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  36.78 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.21 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.21 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  34.71 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  35.67 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.88 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  34.3 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  33.69 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  40.41 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  38.82 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  38.16 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  38.16 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  33.14 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  36.69 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  36.47 
 
 		 187 aa  98.2  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  34.78 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  34.92 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  40.69 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  34.29 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  33.94 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  34.73 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  41.21 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  43.31 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  35.96 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  35 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  33.9 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  40.36 
 
 		 192 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  36.97 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  33.53 
 
 		 437 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  31.76 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  35.68 
 
 		 200 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  35.67 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  30.59 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  29.38 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  33.73 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  33.78 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  33.78 
 
 		 215 aa  90.9  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>