242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3447 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  100 
 
 
193 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  95.53 
 
 
193 aa  303  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  95.38 
 
 
193 aa  294  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  68.71 
 
 
195 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  66.12 
 
 
199 aa  221  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  62.76 
 
 
196 aa  220  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  61.67 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  71.18 
 
 
192 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  57.95 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  64.37 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  61.31 
 
 
198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  62.22 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  59.3 
 
 
196 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  57.59 
 
 
194 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  55 
 
 
188 aa  193  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  53.12 
 
 
188 aa  193  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  55.88 
 
 
196 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  52.08 
 
 
195 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  52.85 
 
 
197 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  54.69 
 
 
197 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  55.11 
 
 
188 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  50.28 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.39 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  51.14 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  49.43 
 
 
185 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  47.73 
 
 
181 aa  158  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  48.5 
 
 
183 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  43.01 
 
 
181 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  44.62 
 
 
183 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  45.64 
 
 
184 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  48.59 
 
 
182 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  48.42 
 
 
183 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  47.13 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  46.84 
 
 
183 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.37 
 
 
183 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.13 
 
 
183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  44.86 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  43.68 
 
 
211 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.58 
 
 
183 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  43.68 
 
 
211 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  42.63 
 
 
211 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  43.96 
 
 
186 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  44.1 
 
 
184 aa  141  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  42.49 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  47.75 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  41.94 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  50.99 
 
 
186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.45 
 
 
193 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  43.96 
 
 
186 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  44.92 
 
 
201 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  46.11 
 
 
208 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  44.51 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  47.5 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  38.66 
 
 
207 aa  134  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  38.66 
 
 
207 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  48.02 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  42.63 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  40 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  38.66 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  45.16 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  46.74 
 
 
204 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  45.45 
 
 
202 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  43.98 
 
 
194 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  42.86 
 
 
215 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  47.12 
 
 
182 aa  131  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  46.55 
 
 
208 aa  131  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  41.21 
 
 
194 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  46.82 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  39.69 
 
 
185 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  40.32 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  38.83 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  42.16 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  46.15 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  41.32 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  39.69 
 
 
194 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.2 
 
 
187 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  40.44 
 
 
214 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  42.7 
 
 
246 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  41.62 
 
 
212 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.18 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  40.94 
 
 
197 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  40.11 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  41.9 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  39.38 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  38.71 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  44.05 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.17 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  40.2 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  40.11 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  44.44 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  41.46 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  40.43 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  42.05 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  41.46 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  47.74 
 
 
189 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  48.99 
 
 
187 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  41.32 
 
 
194 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  43.75 
 
 
186 aa  124  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  40.62 
 
 
188 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>