247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3233 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  90.32 
 
 		 186 aa  344  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  86.96 
 
 		 185 aa  331  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  84.62 
 
 		 183 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  83.52 
 
 		 183 aa  317  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  80.22 
 
 		 183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  79.67 
 
 		 184 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  58.6 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  55.76 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  52.35 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  50.54 
 
 		 192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  50.3 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  50.3 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  54.97 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  45.3 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  47.27 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  49.73 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  51.46 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.17 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  46.24 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  50.3 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  46.24 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  47.28 
 
 		 196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  49.12 
 
 		 249 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  49.71 
 
 		 198 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  45.11 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  45.05 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  44.81 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  48.48 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  45.05 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  49.7 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  49.43 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  45.81 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  47.88 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  47.8 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  47.02 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  45.65 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  49.44 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  48.02 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  52.7 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  46.99 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  44.94 
 
 		 194 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.13 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.62 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  42.64 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  38.1 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  46.02 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  48.86 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  44.26 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  47.43 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  43.48 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.54 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.77 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  45.41 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  46.31 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  38.92 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  38.92 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  38.92 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  48.81 
 
 		 190 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  43.71 
 
 		 184 aa  140  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  41.01 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  38.29 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  39.88 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  44.72 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  42.44 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  41.67 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  38.95 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  43.02 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  40.86 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  41.07 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  40.43 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  38.6 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.95 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  40.85 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  38.78 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  38.64 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  39.71 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  41.1 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  43.93 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  46.15 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  41.92 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  36.73 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  36.73 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  41.92 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  41.76 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  43.18 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  40.12 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  38.95 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  40.8 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  42.26 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  40.37 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  40.8 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  41.56 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  43.2 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  38.27 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  42.05 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  41.33 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>