246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1073 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  73.2 
 
 		 196 aa  300  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  76.44 
 
 		 195 aa  274  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  62.09 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  62.5 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  58.29 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  62.29 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  60.22 
 
 		 199 aa  219  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  62.07 
 
 		 195 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  52.31 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  60.82 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  58.33 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  58.89 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  54.5 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  55.03 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  59.77 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  59.2 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  58.14 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  51.15 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  48.42 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  53.37 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  42.49 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.95 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  47.19 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  49.16 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  48.24 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.07 
 
 		 186 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.94 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.01 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  42.22 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.88 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  41.58 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.63 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  46.11 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  41.99 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  39.89 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  39.89 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  39.89 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  43.43 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  45.25 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  41.01 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.84 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  38.46 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  44.69 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  49.35 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.61 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  44.13 
 
 		 249 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  39.79 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  40.88 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  42.11 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  42.62 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  37.63 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  43.62 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  46.41 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  40.64 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  37.63 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  39.47 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  43.1 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  37.84 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  37.78 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  38.02 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40.46 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  38.95 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.02 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.31 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  43.68 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.7 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  36.27 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  39.06 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  39.64 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  39.88 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  41.56 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  41.95 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  35.33 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  41.38 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  40 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  37.93 
 
 		 180 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  40.72 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  37.89 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  38.97 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  37.5 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  38.86 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  35.48 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  36.04 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  36.98 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  36.42 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  38.92 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  38.92 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  37.11 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  36.36 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  43.45 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  44.14 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  42.95 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  42.95 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  38.38 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  37.36 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  34.72 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>