251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0720 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  55.81 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  53.01 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  54.4 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  57.89 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  49.44 
 
 		 201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  53.89 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  48.04 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  51.83 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  49.18 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.41 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  49.1 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.56 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  47.22 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  48.21 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  51.52 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  50.56 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  47.42 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  45.6 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  50.61 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.99 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  44.39 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.15 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  46.75 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  48.57 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  43.96 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.96 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  45.95 
 
 		 249 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  43.17 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  43.41 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  44.51 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  53.02 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  43.26 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.93 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  49.14 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.08 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  46.29 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  50.3 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  44.44 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  42.63 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  48.15 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  44.97 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  45.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  47.53 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  45.93 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  44.79 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  44.32 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  44.51 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  43.03 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  37.97 
 
 		 193 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  42.26 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  38.33 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.93 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  40.44 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  40.43 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  40.31 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  43.01 
 
 		 194 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  44 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  38.74 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  40.12 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  41.34 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  40.12 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  44.1 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.78 
 
 		 196 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  41.81 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  39.57 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  39.53 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  40.34 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  41.18 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  40.88 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  41.28 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  44.81 
 
 		 198 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  37.99 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  38.42 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  39.68 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  39.79 
 
 		 210 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  42.71 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  46.3 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.31 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  40.11 
 
 		 212 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  42.86 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  40 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  42.17 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  36.32 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  37.36 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  48.34 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  38.07 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  38.58 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  39.69 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  40.59 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  38.58 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  42.31 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  40.49 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  45.91 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  39.31 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  40.34 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  40.74 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  37.5 
 
 		 200 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  40.53 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>