248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1670 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  77.78 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  77.78 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  57.45 
 
 		 192 aa  213  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  62.42 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  56.68 
 
 		 189 aa  204  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  55.08 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  47.45 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  48.37 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  46.53 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  46.2 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  45.36 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.41 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  47.59 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  44.33 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  46.43 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  48 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  45.65 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  46.11 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  45.31 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  45.26 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  46.51 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  44.04 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  43.88 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  47.56 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  44.95 
 
 		 211 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  44.95 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.57 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  47.93 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  44.72 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  44.02 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  44.56 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  42.86 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  42.7 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  44.57 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  44.04 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  43.17 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  47.24 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  46.89 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  45.7 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  47.7 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  43.39 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  41.3 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  40.7 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  42.25 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.81 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  40.61 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  39.9 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  47.85 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  40.61 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.26 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  45.76 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  40.1 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  44 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40.7 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  45.4 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  44.5 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  43.59 
 
 		 220 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  48.3 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  43.98 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  47.65 
 
 		 249 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  43.23 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  40.2 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  41.36 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  44.83 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  42.53 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  41.05 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  45.73 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  44.83 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  41.07 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.28 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  45.71 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  46.29 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  44 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  42.78 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  38.27 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  41.36 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  43.17 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  41.75 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  45.14 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  41.75 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  45.71 
 
 		 226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  45.71 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  47.97 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  40.62 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  43.43 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  46 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  41.21 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  39.39 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  38.71 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  39.39 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  42.22 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  42.22 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  43.1 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>