244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0464 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  82.12 
 
 		 183 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  82.12 
 
 		 183 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  59.89 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  53.18 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  53.33 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  51.11 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  50 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  53.18 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  48.89 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  48.89 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  48.89 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  53.8 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  51.52 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  48.35 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.26 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  51.76 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  51.2 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  45.6 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  50.54 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  49.72 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  44.57 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  44.32 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  48.09 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  46.45 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  48.37 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  48.52 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  47.83 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  48.8 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  43.64 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  48.54 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  49.44 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.24 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  48.5 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  45.05 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  45.26 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  48.02 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  44.92 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  46.49 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  45.45 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40.22 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.38 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  42.71 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  47.7 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  42.11 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  45.29 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.79 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  44.85 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  46.29 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  43.29 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  45.81 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  40.64 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  40.94 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  43.93 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  41.24 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  40.88 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.32 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  39.38 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.67 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.53 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  40.49 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  47.27 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  44.57 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  43.64 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  46.67 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  44.25 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  42.48 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  47.34 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  39.33 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  39.3 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  45.1 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  42.08 
 
 		 197 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  40.96 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  40.56 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.62 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  42.16 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  38.15 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  40.96 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  48.28 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  48.28 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  37.36 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  39.77 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  37.14 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  46.55 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.37 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  38.69 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  39.46 
 
 		 206 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  40.49 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  39.29 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  38.59 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  42.48 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  41.45 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  41.95 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  41.95 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  41.07 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  36.31 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  42.42 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  45.06 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  41.14 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>