240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3965 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  53.5 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  52.23 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2382  hypothetical protein  56.05 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2429  LemA family protein  56.05 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2423  LemA family protein  56.05 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0706074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  56.58 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  53.95 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  45.74 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  49.68 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  45.74 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  46.2 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  51.16 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  46.81 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  46.06 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  41.76 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  43.48 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  44.92 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  42.78 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.7 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  41.85 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  49.68 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  41.85 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  42.39 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  47.73 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  40.11 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.44 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  46.39 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  44.85 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  40.76 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  41.94 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  44.85 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40.32 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  49.02 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  40.72 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  43.89 
 
 		 196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  42.02 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  43.72 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  40.41 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  42.71 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  44.81 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  43.01 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.57 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  46.71 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  40.32 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  40.82 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  38.34 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  41.21 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  44.44 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  41.71 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.93 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  43.59 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  43.23 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  39.27 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  39.88 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  40.66 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  40.96 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  38.89 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  41.03 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  40.48 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  43.3 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  46.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  43.3 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  36.84 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  40.94 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.93 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  36.87 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  40.36 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  38.33 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  42.27 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  40.78 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  50.63 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.63 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  36.56 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  38.1 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  42.62 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  51.68 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  39.04 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  38.74 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  40 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  38.34 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  41.71 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  39.06 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  40 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  40.62 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  39.43 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  42.29 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  43.5 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  51.01 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  37.76 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  40 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  37.5 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.5 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  43.5 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.54 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  39.06 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.34 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>