243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0165 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  48.26 
 
 
184 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  48.04 
 
 
184 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  45.86 
 
 
183 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  46.45 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  46.95 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  49.4 
 
 
188 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  54.11 
 
 
185 aa  157  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  44.19 
 
 
188 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  43.02 
 
 
183 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  44.94 
 
 
180 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  44.94 
 
 
180 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  44.94 
 
 
180 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  44.94 
 
 
180 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  44.09 
 
 
182 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  46.15 
 
 
188 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  44.94 
 
 
180 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  48.5 
 
 
188 aa  148  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.17 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  40.36 
 
 
183 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  40.33 
 
 
185 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  40.36 
 
 
183 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  43.45 
 
 
186 aa  140  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  42.94 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  44 
 
 
196 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  39.64 
 
 
184 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  42.37 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40 
 
 
183 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  39.16 
 
 
183 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  40.22 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  41.07 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  38.34 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  38.69 
 
 
249 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  44.17 
 
 
180 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  39.89 
 
 
201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  44.03 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  40.48 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  37.89 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  40.49 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  39.63 
 
 
184 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  39.08 
 
 
195 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  37.71 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  37.36 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  39.88 
 
 
187 aa  124  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  40.12 
 
 
181 aa  123  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  37.95 
 
 
189 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  38.98 
 
 
187 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  39.88 
 
 
186 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  38.37 
 
 
192 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  36.81 
 
 
185 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  40.65 
 
 
185 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  36.22 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  38.31 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  36.31 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  38.27 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  38.46 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  33.92 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  36.09 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.97 
 
 
187 aa  118  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  37.63 
 
 
208 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  38.25 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  36.92 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.07 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  38.5 
 
 
193 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  37.93 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  36.51 
 
 
194 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.2 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  38.18 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  36.7 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  37.72 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  36.84 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  33.53 
 
 
190 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  36.81 
 
 
195 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  38.55 
 
 
196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  33.67 
 
 
202 aa  111  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  36.9 
 
 
188 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  35.03 
 
 
199 aa  111  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  38.22 
 
 
208 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  37.65 
 
 
187 aa  110  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  36.98 
 
 
203 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  36.22 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  36.46 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  39.1 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  36.26 
 
 
192 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  36.41 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  36.46 
 
 
201 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  35.91 
 
 
244 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  37.5 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  37.5 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  35.58 
 
 
191 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  41.84 
 
 
437 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  38.55 
 
 
198 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  36.52 
 
 
196 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  35.57 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  37.93 
 
 
194 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  32.45 
 
 
201 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>