240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0788 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2465  LemA family protein  70 
 
 		 191 aa  254  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  63.78 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  70.48 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  36.17 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  33.87 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  39.29 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  35.33 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  34.27 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.42 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  34.81 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  36.31 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  33.7 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  38.46 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  36.46 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  37.91 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  36.09 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  36.97 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  36.81 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  32.6 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  32.6 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  37.42 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  33.33 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  32.75 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  34.03 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  32.46 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  32.6 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  33.16 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  34.44 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  34.64 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  30.48 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.57 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  35.93 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  30.94 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.95 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0120  LemA family protein  33.93 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000229196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  32.99 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  32.95 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  33.33 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  35.76 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  29.59 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  35.52 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  32.22 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  33.89 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  33.91 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  36.02 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  33.33 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  36.55 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  33.14 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  33.95 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  32.42 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  31.75 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  34.38 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  29.83 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  31.49 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  29.76 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  34.64 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.61 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  32.04 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  35.94 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  35.06 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  32.97 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  34.39 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  33.9 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  36.97 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  32.73 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  35.47 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  29.05 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  31.35 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  29.05 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  31.98 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  29.05 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  34.09 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  29.76 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  33.56 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  29.32 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  31.05 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  33.52 
 
 		 208 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  31 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  31.03 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  33.73 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  31.58 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  31.41 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  31.41 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  32.5 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  29.14 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  31.25 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  30.18 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  35.09 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  29.14 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  29.53 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  29.12 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  29.27 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  34.16 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  30.3 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  32.79 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>