244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0157 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  83.51 
 
 		 189 aa  322  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  85.88 
 
 		 189 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  79.79 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  79.79 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  79.79 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  84.04 
 
 		 189 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  78.19 
 
 		 188 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  78.19 
 
 		 188 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  78.19 
 
 		 188 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  77.66 
 
 		 188 aa  309  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  77.59 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0095  LemA family protein  55.32 
 
 		 187 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  37.43 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  34.46 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  43.67 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  37.5 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  36.97 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  39.63 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.89 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  36.93 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  36.93 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  37.21 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  35.88 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  32.92 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3606  hypothetical protein  34.43 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  38.27 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  35.29 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  33.52 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  33.7 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  34.81 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  33.51 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  35.56 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  31.11 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  38.67 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  32.6 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  34.38 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  32.95 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.7 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  32.95 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  32.04 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  32.75 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  34.44 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  29.44 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  34.13 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  35.95 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  34.39 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  30.86 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  31.21 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  34.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  34.3 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  30.43 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  35.57 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  32.22 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  29.26 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  32.72 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  30.38 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  30.86 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  32.24 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  30.38 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  34.15 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  32.77 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  28.73 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  33.78 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  30.68 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  32.57 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  30.12 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  28.26 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  30.11 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  34.39 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  32.75 
 
 		 434 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.39 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  33.13 
 
 		 434 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2848  LemA family protein  33.56 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  32.3 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.62 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  29.01 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  30.99 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  32.26 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  33.13 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  27.95 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  33.14 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  31.61 
 
 		 433 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  29.38 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  30.86 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  31.45 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  31.98 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  28.05 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  33.56 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  30.77 
 
 		 211 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  29.19 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  28.04 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  32.9 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>