239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0849 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0849  LemA family protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4437  LemA family protein  40.41 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4499  LemA family protein  39.9 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.625347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  29.81 
 
 		 183 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  30.36 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  30.95 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  31.29 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  30.54 
 
 		 183 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  29.94 
 
 		 183 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  31.43 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  30.63 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  27.37 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  29.19 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  32.92 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  32.32 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.95 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  31.85 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  30.3 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  30.38 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.34 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  29.34 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  27.01 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  28.74 
 
 		 183 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  28.07 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  28.48 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  32.41 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  28.48 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  28.48 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  28.18 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  27.67 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  26.32 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  26.32 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  26.32 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  27.65 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  26.59 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  29.41 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  27.67 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  27.92 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.92 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  26.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  30.67 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  29.27 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  30.67 
 
 		 187 aa  72  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  28.57 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.91 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  33.12 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  27.92 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  29.8 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  29.01 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  25.97 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  27.5 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  30.19 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  28.38 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  26.46 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  28.47 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  24.2 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  25.29 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  26.8 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  30.34 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  26.19 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  26.19 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  29.82 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  27.16 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  28.17 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  30.41 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  29.3 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  28.28 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  26.01 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0664  lipoprotein  25.6 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.742041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  26.9 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  28.16 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  27.04 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  29.31 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  29.31 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  29.31 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  29.68 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  29.37 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  29.49 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  29.3 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  24.24 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  30.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  27.59 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  25.44 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  26.79 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  25.15 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  25.15 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  25.6 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  26.79 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  27.74 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  25 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  29.41 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  28.66 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  29.68 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  25.13 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  26.44 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>