238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4437 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4499  LemA family protein  99.6 
 
 
250 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.625347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4437  LemA family protein  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0849  LemA family protein  40.41 
 
 
257 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  37.5 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  36.75 
 
 
184 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  35.12 
 
 
180 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  34.86 
 
 
185 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  34.48 
 
 
183 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  32.74 
 
 
186 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  35.84 
 
 
183 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  33.53 
 
 
183 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  34.52 
 
 
183 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  32.53 
 
 
186 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  33.54 
 
 
180 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  33.54 
 
 
180 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  36.42 
 
 
183 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  33.54 
 
 
180 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  33.53 
 
 
183 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  32.37 
 
 
184 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  32.53 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  32.5 
 
 
188 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  31.29 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  29.31 
 
 
181 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  32.74 
 
 
188 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  31.65 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  32.7 
 
 
184 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  31.79 
 
 
182 aa  91.7  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  32.03 
 
 
180 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  32.5 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  28.66 
 
 
184 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  30.99 
 
 
201 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  29.82 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  30.46 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  32.68 
 
 
188 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  30.87 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  28.4 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  29.38 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  31.54 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  33.17 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  30.81 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  30.18 
 
 
192 aa  82  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  32.03 
 
 
208 aa  82  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  33.93 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.78 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  31.43 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  29.11 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  31.37 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  27.27 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  27.68 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  27.68 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  29.01 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  29.89 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  27.44 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  29.01 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  26.37 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  31.13 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  28.19 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  26.67 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  29.56 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  28.86 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  32.92 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  24.69 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  26.2 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  28.4 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  29.7 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  30 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  26.95 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  27.16 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  28.57 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  27.44 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  29.88 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  29.48 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  27.44 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  30.57 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  29.81 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2382  hypothetical protein  27.33 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2429  LemA family protein  27.33 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2423  LemA family protein  27.33 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0706074  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  28.21 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  27.32 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  30.49 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  30.38 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  28.98 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  29.01 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  25.93 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  27.93 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  26.45 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  25.82 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  29.63 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  27.71 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  30.97 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  29.3 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0664  lipoprotein  23.78 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.742041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  27.68 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  29.58 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  28.74 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  29.84 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  28.21 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  28.66 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>