240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3391 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  84.34 
 
 		 220 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  89.44 
 
 		 224 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  89.44 
 
 		 226 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  90.45 
 
 		 222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  77.07 
 
 		 206 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  75.26 
 
 		 207 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  75.26 
 
 		 207 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  68.81 
 
 		 203 aa  298  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  70.75 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  68 
 
 		 204 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  69.23 
 
 		 197 aa  291  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  67.5 
 
 		 202 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  69.95 
 
 		 210 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  69.7 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  68.72 
 
 		 203 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  69.78 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  68.88 
 
 		 244 aa  276  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  66.84 
 
 		 204 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  66.49 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  64 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  61.69 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  65.96 
 
 		 200 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  63.5 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  65.1 
 
 		 195 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1511  LemA family protein  67.98 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  63.27 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  63.32 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  63.27 
 
 		 201 aa  255  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  62.44 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  66.67 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  62.76 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  66.11 
 
 		 202 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  67.22 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  64.8 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  64.8 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1074  LemA family protein  63.08 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0145  LemA protein  64.67 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0331  hypothetical protein  62.94 
 
 		 201 aa  247  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  60.41 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2694  LemA family protein  63.59 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0664  lipoprotein  66.48 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.742041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0381  LemA family protein  60.58 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4853  LemA family protein  63.13 
 
 		 200 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0102  hypothetical protein  65.54 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.95764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0259  LemA family protein  65.71 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  55.38 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  53.33 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  56.35 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  54.87 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  51.53 
 
 		 194 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  52.06 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  53.59 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  54.87 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  48.47 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  53.5 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  52.74 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  49.49 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  53.19 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  48.48 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  57.32 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  51 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  50.49 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  51.98 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  50.49 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  50.52 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  50.52 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  50.52 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  49.75 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  52.28 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  50 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  44.81 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  47.03 
 
 		 202 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  53.93 
 
 		 194 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  48.98 
 
 		 193 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  52.17 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  52.85 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  52.75 
 
 		 196 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  59.86 
 
 		 202 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2912  LemA family protein  50.55 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000943638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2022  LemA family protein  62.25 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0413  LemA family protein  57.93 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  57.23 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  56.6 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  47.45 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  55.97 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0393  LemA family protein  56.36 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.329178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0879  hypothetical protein  47.96 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  46.97 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  51.96 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  58 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  49.18 
 
 		 200 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  45.45 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  44.33 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  47.31 
 
 		 192 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>