49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  317  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 340 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  54.73 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  63.89 
 
 		 347 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  63.38 
 
 		 347 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  56.44 
 
 		 351 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  46.39 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 		 341 aa  97.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  45.29 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  41.61 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  43.37 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  38.75 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  37.87 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  47.59 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  28.18 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  38.8 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  35.59 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  43.98 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  27.45 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  26.55 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  32.82 
 
 		 234 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  42.68 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  28.47 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  39.66 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  33.54 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  30.12 
 
 		 195 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.8 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  30.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  28.57 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  37.11 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  26.63 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  30.36 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  31.18 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  27.22 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  30.65 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  32.06 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  28.12 
 
 		 184 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2408  hypothetical protein  41.41 
 
 		 160 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  36.29 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  26.79 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>