30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1352 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  100 
 
 
201 aa  384  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  54.34 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  56.83 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  54.32 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  46.55 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  40.2 
 
 
225 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  42.77 
 
 
198 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  45.11 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  36.19 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  47.16 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  35 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  37.71 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  37.21 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 
340 aa  71.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  39.62 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40.12 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  37.8 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  38.1 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
327 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  45.28 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
347 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
347 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
337 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
337 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
337 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  47.8 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  39.89 
 
 
351 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15380  hypothetical protein  29.33 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  27.16 
 
 
180 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>