87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12628 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  70.61 
 
 
347 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  71.75 
 
 
347 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  67.91 
 
 
337 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  67.91 
 
 
337 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  67.91 
 
 
337 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  50.46 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  46.42 
 
 
327 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  59.06 
 
 
177 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  45.57 
 
 
174 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
172 aa  96.7  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  60.69 
 
 
170 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
148 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  34.9 
 
 
205 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
204 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  39.58 
 
 
182 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  38.82 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  38.73 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
159 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  39.55 
 
 
167 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 
153 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  36.97 
 
 
177 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  37.27 
 
 
168 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
166 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
137 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  40.14 
 
 
180 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  39.89 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
157 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  41.57 
 
 
181 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  33.68 
 
 
158 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  36.44 
 
 
149 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
170 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
151 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  32.64 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  36.63 
 
 
184 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  30.52 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  40 
 
 
142 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
153 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
166 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  26.75 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
155 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  40.48 
 
 
157 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  40.48 
 
 
160 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  40.48 
 
 
160 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  26.57 
 
 
221 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  40.48 
 
 
160 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
441 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  40.48 
 
 
160 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  40.48 
 
 
160 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  40.48 
 
 
160 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
180 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  42.47 
 
 
158 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
158 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
157 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
169 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.93 
 
 
163 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
156 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  45.35 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
171 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
181 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.82 
 
 
159 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  24.53 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
155 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
160 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
140 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>