103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3059 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 174 aa  337  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 		 200 aa  147  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  46.54 
 
 		 205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 		 347 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 347 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 341 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  45.57 
 
 		 351 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 148 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 337 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 337 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 337 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 340 aa  95.5  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 166 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  39.67 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  33.77 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  36.73 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  36.5 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.76 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.76 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  45.65 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  36.03 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  36.03 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  36.03 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  36.03 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.21 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  22.22 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 377 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.17 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.3 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  36.84 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  24.65 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  35.56 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  42.37 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 361 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 456 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 135 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 135 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 155 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 165 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 315 aa  41.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 304 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>