229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  58.38 
 
 
204 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  58.08 
 
 
200 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 
184 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  53.55 
 
 
172 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 
174 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
327 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
340 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
159 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
347 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
347 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  34.9 
 
 
351 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
148 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
341 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
164 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  30.72 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
169 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  24.67 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  24 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  31.93 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
441 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
166 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  29.7 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.86 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
456 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
305 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  24.65 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
155 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.07 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
525 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  31.4 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
143 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
142 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.37 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  34.57 
 
 
131 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  42.25 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
146 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.25 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.25 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  26.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  32.93 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
218 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
130 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
162 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.42 
 
 
163 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  32.18 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  32.18 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  45.9 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  35.37 
 
 
131 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  25.52 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  32.84 
 
 
133 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
131 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  37.14 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
315 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  46.38 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
298 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
155 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  34.57 
 
 
132 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
156 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
170 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  39.34 
 
 
145 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
149 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3077  phosphohydrolase  34.33 
 
 
180 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.848469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>