186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6207 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  70.87 
 
 		 211 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  70.08 
 
 		 216 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  70.97 
 
 		 180 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  70.08 
 
 		 195 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.43 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 142 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.43 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  39.29 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.67 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 138 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.17 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 182 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 536 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  31.95 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.63 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.63 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.63 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 179 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  38.3 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  32.82 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  33.87 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  35.88 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  50 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 166 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 147 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  36.28 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 151 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 150 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.23 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 142 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.67 
 
 		 2449 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  44.26 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 525 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  37.1 
 
 		 163 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 134 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  27 
 
 		 152 aa  47  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  39.74 
 
 		 205 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.18 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.18 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.18 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>