124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2080 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 137 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 140 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  37.5 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 136 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  32.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.8 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.78 
 
 		 430 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  41.54 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  36.99 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  46.67 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0396  NUDIX hydrolase  21.38 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  0.770982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  24.46 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1770  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.82 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  39.62 
 
 		 524 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  26.42 
 
 		 143 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1839  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.53 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.2 
 
 		 336 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  35.06 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.39 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  35.42 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 272 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 542 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  25 
 
 		 424 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 102 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 151 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  37.29 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 181 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>