More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  77.54 
 
 		 174 aa  210  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  65.87 
 
 		 282 aa  206  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  68.42 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  68.42 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  68.42 
 
 		 270 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  64.67 
 
 		 268 aa  193  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  65.99 
 
 		 248 aa  183  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  60.98 
 
 		 302 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  63.58 
 
 		 272 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 158 aa  180  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  68.89 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  53.75 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  63.85 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  49.39 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  52.23 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  52.45 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  53.15 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 206 aa  140  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  52.38 
 
 		 203 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  48.1 
 
 		 430 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  48.63 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  51.88 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 536 aa  71.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  41.41 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.41 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.15 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.97 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  28.04 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.25 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  28.97 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  26.55 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  26.55 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  28.21 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  27.1 
 
 		 265 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  32.38 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.96 
 
 		 308 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 322 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.5 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  40.51 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 322 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>