More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4202 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  300  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 		 140 aa  227  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  42.96 
 
 		 424 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  37.31 
 
 		 169 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 174 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 302 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 237 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  34.9 
 
 		 292 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 268 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  32.87 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  33.08 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  35.07 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  38.14 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 536 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 		 336 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 310 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.5 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.47 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  31.97 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  38 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  32.56 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  39.24 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  39.24 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  39.24 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  39.24 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.8 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.37 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  35.77 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>