More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0392 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  45.83 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 		 583 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  29.86 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.54 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  25.66 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  25.66 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 351 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  32.21 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  27.46 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  25.81 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  25.36 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.86 
 
 		 343 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 326 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  24.49 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  24.46 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.29 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 		 336 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  28.69 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  28.67 
 
 		 301 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 272 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0863  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.92 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  36.51 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  47.73 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  24.53 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  24.19 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.47 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2782  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000489466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  23.93 
 
 		 292 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  23.02 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.58 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.29 
 
 		 363 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  25 
 
 		 317 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  26.77 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>