93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4431 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  60.14 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  58.28 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  61.33 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  47.97 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.9 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  46.26 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 324 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.41 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 341 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 296 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 326 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  34.35 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  33.33 
 
 		 475 aa  46.6  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  29.25 
 
 		 336 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  41.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  36.19 
 
 		 424 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.61 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  32.11 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.77 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.77 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.77 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 181 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.77 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 146 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.42 
 
 		 211 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 142 aa  42  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32.26 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32.26 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.98 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  34.51 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  47.92 
 
 		 354 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 343 aa  40.8  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  36.07 
 
 		 224 aa  40.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>