More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0237 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  80.58 
 
 		 140 aa  229  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  79.85 
 
 		 139 aa  224  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  76.12 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  51.82 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  49.17 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 144 aa  100  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 583 aa  93.6  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.84 
 
 		 577 aa  81.3  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  44.54 
 
 		 424 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  38.28 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.29 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  30.6 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  30.67 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  38.53 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 302 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  35.25 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  36.36 
 
 		 313 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.07 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  36.08 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  32.37 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.33 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  41.67 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  31.62 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  38.54 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  38.54 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.83 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  38.54 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  38.54 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1399  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.373251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 315 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34.96 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  38.32 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  39.18 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>