More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1007 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
137 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
536 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  32 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  36.81 
 
 
169 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  35.48 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  55.56 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.99 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  56.6 
 
 
430 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
229 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 
424 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
216 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  46.25 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  46.25 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
322 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.69 
 
 
577 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
219 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  48.48 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
282 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  43.96 
 
 
268 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  40.86 
 
 
248 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
270 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 
324 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
302 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  40 
 
 
272 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
176 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  44.44 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
229 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  45.59 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
341 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  30.39 
 
 
308 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  45.59 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.06 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  42.5 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  35.83 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  49.15 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  41.54 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
311 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
311 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
208 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
311 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.06 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
187 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  34.04 
 
 
203 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
141 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
356 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  41.67 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32 
 
 
146 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
182 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>