More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6062 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  86.91 
 
 
282 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  85.45 
 
 
270 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  85.45 
 
 
270 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  85.45 
 
 
270 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  70.41 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  73.51 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  59.39 
 
 
302 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  65.36 
 
 
174 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  64.67 
 
 
169 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  70 
 
 
158 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  68.84 
 
 
151 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  48.11 
 
 
182 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 
166 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 
174 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  58.96 
 
 
141 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  52.8 
 
 
219 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
206 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 
158 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
203 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  50.61 
 
 
205 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
182 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  47.52 
 
 
430 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  47.48 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  47.33 
 
 
160 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
142 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
149 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
164 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
143 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
150 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
153 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  40.62 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
129 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.91 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
140 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
143 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  40 
 
 
150 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
180 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
138 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
143 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
144 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
144 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
145 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
139 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
136 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
139 aa  55.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
137 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
146 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
149 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
137 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.71 
 
 
424 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
148 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
185 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  40 
 
 
169 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.92 
 
 
149 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
155 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.54 
 
 
167 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.4 
 
 
149 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  28.12 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
154 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
153 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
161 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.23 
 
 
153 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  30.92 
 
 
149 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
161 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
351 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
137 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
149 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
153 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  32.82 
 
 
161 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  32.82 
 
 
161 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
157 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>