More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2202 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  289  9e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 140 aa  215  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  76.12 
 
 		 146 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  47.48 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 583 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.3 
 
 		 577 aa  77.8  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  36.23 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 430 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.78 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.24 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 282 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  31.43 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  32.21 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.34 
 
 		 317 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  35.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.97 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.43 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  41 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  42.71 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  29.93 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  42.71 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  42.71 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  42.71 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  42.71 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.19 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.8 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 351 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 303 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>