222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
205 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  75.53 
 
 
206 aa  285  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  68.95 
 
 
182 aa  248  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  71.23 
 
 
174 aa  214  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  64.46 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  65.1 
 
 
158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  56.74 
 
 
182 aa  188  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  62.34 
 
 
166 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  55.92 
 
 
258 aa  173  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  53.22 
 
 
430 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  56.41 
 
 
203 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  58.04 
 
 
160 aa  161  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  58.04 
 
 
174 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 
302 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
270 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
270 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
270 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 
282 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  52.67 
 
 
248 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  54.29 
 
 
169 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
268 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  57.45 
 
 
151 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  51.39 
 
 
141 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
149 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
150 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
142 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
153 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
137 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.58 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
143 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
583 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35 
 
 
317 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
299 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
143 aa  54.7  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.65 
 
 
424 aa  54.7  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31 
 
 
310 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
311 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  30.77 
 
 
325 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
322 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
301 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  34.23 
 
 
150 aa  52  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
139 aa  51.6  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35 
 
 
302 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
146 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
314 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
142 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  31.73 
 
 
137 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
138 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  38.1 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
132 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
351 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  36 
 
 
129 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
322 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  28.32 
 
 
363 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
155 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
166 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
140 aa  48.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  29.81 
 
 
137 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  34.91 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  34.91 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  35.24 
 
 
147 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  25.95 
 
 
137 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
137 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
536 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
315 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>