More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0852 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 		 577 aa  1147    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  23.18 
 
 		 473 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 459 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  37.85 
 
 		 448 aa  126  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  25.88 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.25 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.2 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.82 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.2 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.2 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.2 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.2 
 
 		 397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.44 
 
 		 397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.58 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  35.98 
 
 		 424 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.44 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  32.75 
 
 		 394 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.26 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.44 
 
 		 397 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  35.29 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.84 
 
 		 404 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.29 
 
 		 404 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  30.67 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  29.84 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.95 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  22.88 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.3 
 
 		 402 aa  103  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  32.07 
 
 		 436 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  33.14 
 
 		 407 aa  101  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  30.38 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  30.43 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  30.38 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.41 
 
 		 401 aa  100  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  31.4 
 
 		 484 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  32.64 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.64 
 
 		 402 aa  98.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  31.08 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 		 454 aa  97.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  31.09 
 
 		 437 aa  97.1  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  32.22 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  31.28 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.56 
 
 		 402 aa  96.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  27.78 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0683  poly(A) polymerase I  29.11 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  26.46 
 
 		 462 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  27.4 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  28.2 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.3 
 
 		 399 aa  95.9  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  30.68 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1131  poly(A) polymerase  32.22 
 
 		 453 aa  95.1  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  28.21 
 
 		 427 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 442 aa  95.5  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  30.47 
 
 		 465 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  30.47 
 
 		 465 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  30.47 
 
 		 454 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  30.04 
 
 		 454 aa  94  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  30.04 
 
 		 454 aa  94  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  30.04 
 
 		 454 aa  94  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  28.32 
 
 		 457 aa  94  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  30.04 
 
 		 454 aa  94  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05829  poly(A) polymerase (PAP) (Plasmid copy number protein)  32.76 
 
 		 455 aa  93.6  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.832163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  29.12 
 
 		 513 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  38.12 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3101  poly(A) polymerase  32.24 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.87683e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  30.04 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  29.12 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  30.04 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  29.12 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  29.12 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  28.37 
 
 		 467 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  26.06 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  29.46 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  30.71 
 
 		 466 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3172  poly(A) polymerase  28.47 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000541948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  28.01 
 
 		 491 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1467  poly(A) polymerase  31.36 
 
 		 546 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0691  poly(A) polymerase family protein  32.02 
 
 		 425 aa  91.3  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  28.42 
 
 		 435 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0778  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  28.67 
 
 		 424 aa  91.3  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000683144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1451  poly(A) polymerase  33.88 
 
 		 497 aa  90.9  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.584195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2456  poly(A) polymerase  27.91 
 
 		 520 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1775  polyA polymerase  33.88 
 
 		 477 aa  90.5  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  31.67 
 
 		 438 aa  90.5  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  33.15 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  28.42 
 
 		 435 aa  90.5  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  29.67 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  32.96 
 
 		 452 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.04 
 
 		 400 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>