More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2762 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  100 
 
 		 456 aa  922    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  71.97 
 
 		 447 aa  594  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  59.22 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2862  poly(A) polymerase  60.61 
 
 		 521 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2456  poly(A) polymerase  60.37 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0882  poly(A) polymerase  58.33 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2627  polynucleotide adenylyltransferase protein  56.36 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0857566  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2777  Poly(A) polymerase, PcnB  56.21 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0701742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2914  poly(A) polymerase  56.19 
 
 		 529 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  61.24 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2627  poly(A) polymerase  57.51 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3845  Poly(A) polymerase, PcnB  57.04 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.723142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0727  poly(A) polymerase  56.78 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2491  poly(A) polymerase  57.92 
 
 		 538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.346096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0758  poly(A) polymerase  56.68 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0274  poly(A) polymerase  56.45 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0677  poly(A) polymerase  56.57 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3304  poly(A) polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2320  polyA polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3314  polyA polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3271  poly(A) polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.264957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3955  Poly(A) polymerase  56.74 
 
 		 529 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0305826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0507  polyA polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0744  poly(A) polymerase  56.74 
 
 		 529 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0495763  normal  0.506624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1092  polyA polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2199  poly(A) polymerase  56.07 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1314  polyA polymerase  52.42 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0652  poly(A) polymerase  56.8 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0675  poly(A) polymerase  50.88 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  53.7 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  53.12 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  48.6 
 
 		 535 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3561  poly(A) polymerase  47.07 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876731  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2188  poly(A) polymerase  48.46 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.891467  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1973  poly(A) polymerase  47.25 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2991  poly(A) polymerase  47.16 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.406392  normal  0.256154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1467  poly(A) polymerase  45.08 
 
 		 546 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1769  poly(A) polymerase  49.88 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2418  poly(A) polymerase  46.74 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2991  poly(A) polymerase  46.74 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2509  poly(A) polymerase  45.33 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  43.78 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  42.64 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  43.46 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  46.42 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  44.9 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  43.45 
 
 		 462 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  45.48 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3131  poly(A) polymerase  43.09 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000115831  normal  0.0863023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  43.86 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  43.67 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1451  poly(A) polymerase  47.42 
 
 		 497 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.584195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  45.01 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  43.64 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1775  polyA polymerase  47.42 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0696  poly(A) polymerase  43.55 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000117677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4310  polyA polymerase  41.27 
 
 		 474 aa  359  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  44.37 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  42.31 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0562  poly(A) polymerase  46.1 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057959  hitchhiker  0.000000459725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  44.31 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  44.12 
 
 		 496 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  46.19 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  41.99 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  42.69 
 
 		 421 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  41.07 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  42.65 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  43.03 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  42.38 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  47.03 
 
 		 465 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  42.38 
 
 		 513 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  43.24 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3130  poly(A) polymerase  43.38 
 
 		 494 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  43.03 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  42.38 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3470  poly(A) polymerase I  42.62 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3340  poly(A) polymerase I  42.62 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.71757e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  42.41 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1008  poly(A) polymerase I  43.91 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000170509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  45.73 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  42.41 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  42.41 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3935  poly(A) polymerase  42.82 
 
 		 415 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000967164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  42.23 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  42.69 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  41.78 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  41.78 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  43 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  42.82 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  43.2 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  42.82 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002563  poly(A) polymerase  42.21 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000329901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  42.92 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0683  poly(A) polymerase I  42.58 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0582  poly(A) polymerase  41.8 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>