More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2491 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2491  poly(A) polymerase  100 
 
 		 538 aa  1097    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.346096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2320  polyA polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3314  polyA polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3845  Poly(A) polymerase, PcnB  77.17 
 
 		 512 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.723142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1314  polyA polymerase  78.38 
 
 		 514 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0677  poly(A) polymerase  77.49 
 
 		 512 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1092  polyA polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0507  polyA polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3304  poly(A) polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3955  Poly(A) polymerase  81.45 
 
 		 529 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0305826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0744  poly(A) polymerase  82.32 
 
 		 529 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0495763  normal  0.506624 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2199  poly(A) polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0274  poly(A) polymerase  74.02 
 
 		 518 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0727  poly(A) polymerase  74.58 
 
 		 518 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2627  poly(A) polymerase  79 
 
 		 512 aa  760    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0652  poly(A) polymerase  82.35 
 
 		 461 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0758  poly(A) polymerase  74.21 
 
 		 518 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3271  poly(A) polymerase  78.79 
 
 		 515 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.264957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2627  polynucleotide adenylyltransferase protein  65.12 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0857566  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2456  poly(A) polymerase  63.94 
 
 		 520 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2862  poly(A) polymerase  63.82 
 
 		 521 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2914  poly(A) polymerase  70 
 
 		 529 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2777  Poly(A) polymerase, PcnB  68.29 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0701742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0882  poly(A) polymerase  59.91 
 
 		 471 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  60.51 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  58.14 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  58.28 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  51.29 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1973  poly(A) polymerase  55.58 
 
 		 531 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  58.95 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0675  poly(A) polymerase  54.55 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  56.21 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  56.87 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2188  poly(A) polymerase  53.99 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.891467  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3561  poly(A) polymerase  51.35 
 
 		 550 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876731  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2991  poly(A) polymerase  52.81 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1467  poly(A) polymerase  52.71 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2418  poly(A) polymerase  52.81 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1769  poly(A) polymerase  52.3 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2991  poly(A) polymerase  51.82 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.406392  normal  0.256154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2509  poly(A) polymerase  51.9 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  49.89 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  50.11 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  49.55 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  48.21 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  49.33 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  46.37 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  46.58 
 
 		 491 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  49.88 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  50 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  49.52 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  49.77 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  49.52 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  50.12 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  47.75 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  44.24 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  44.01 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4310  polyA polymerase  41.83 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  45.07 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3130  poly(A) polymerase  42.02 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  45.02 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  44.01 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  44.79 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0562  poly(A) polymerase  46.99 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057959  hitchhiker  0.000000459725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  49.28 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  44.42 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  50.26 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  48.22 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  44.31 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3935  poly(A) polymerase  47.97 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000967164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0677  poly(A) polymerase  52.53 
 
 		 411 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.34665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  47.57 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3172  poly(A) polymerase  43.12 
 
 		 449 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000541948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3131  poly(A) polymerase  44.76 
 
 		 480 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000115831  normal  0.0863023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03548  poly(A) polymerase I  47.04 
 
 		 439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.339485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  44.02 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1451  poly(A) polymerase  48.62 
 
 		 497 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.584195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2046  poly(A) polymerase  48.12 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  44.21 
 
 		 484 aa  360  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1775  polyA polymerase  48.62 
 
 		 477 aa  360  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  42.17 
 
 		 421 aa  359  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0778  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  45.24 
 
 		 424 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000683144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  43.78 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0696  poly(A) polymerase  43.99 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000117677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  42.06 
 
 		 441 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0582  poly(A) polymerase  41.48 
 
 		 459 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  41.76 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  42.86 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  44.68 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002563  poly(A) polymerase  43.49 
 
 		 453 aa  349  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000329901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  41.53 
 
 		 505 aa  349  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  43.46 
 
 		 457 aa  349  9e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  45.22 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  45.26 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  42.26 
 
 		 462 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  45.5 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3470  poly(A) polymerase I  43.38 
 
 		 491 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3340  poly(A) polymerase I  43.38 
 
 		 491 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.71757e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  46.12 
 
 		 437 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  45.48 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>