More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0026 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  100 
 
 
424 aa  849    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  98.58 
 
 
422 aa  836    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 
448 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 
464 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 
584 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  35.2 
 
 
448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 
442 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 
450 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  39.28 
 
 
394 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  32.08 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 
583 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  45.21 
 
 
434 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  33.63 
 
 
437 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  29.43 
 
 
436 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  38.65 
 
 
410 aa  224  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  29.2 
 
 
436 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  31.93 
 
 
451 aa  216  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.33 
 
 
403 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  41.15 
 
 
436 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.18 
 
 
401 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.17 
 
 
398 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.16 
 
 
402 aa  204  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.75 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  46.78 
 
 
399 aa  199  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.75 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.46 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.75 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.1 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.79 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.44 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  30.05 
 
 
407 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.33 
 
 
404 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.87 
 
 
404 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.37 
 
 
397 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
473 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.27 
 
 
397 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.12 
 
 
397 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.12 
 
 
397 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.12 
 
 
397 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.12 
 
 
397 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.54 
 
 
464 aa  189  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.12 
 
 
397 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.07 
 
 
397 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.71 
 
 
397 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 
499 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.98 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  27.94 
 
 
427 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.94 
 
 
427 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
552 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  28.36 
 
 
471 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
490 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
483 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 
507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  30.21 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
483 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
491 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 
490 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  31.03 
 
 
409 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
486 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  28.69 
 
 
523 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  38.4 
 
 
510 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  33.53 
 
 
483 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  29.38 
 
 
475 aa  156  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
525 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
500 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  28.35 
 
 
484 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  36.55 
 
 
457 aa  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
502 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
483 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
492 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
462 aa  151  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  35.15 
 
 
415 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  27.05 
 
 
483 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  28.67 
 
 
479 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  33.72 
 
 
386 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  27.17 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
464 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
496 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  37.32 
 
 
467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  37.32 
 
 
491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  38.91 
 
 
410 aa  146  9e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  34.66 
 
 
485 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  28.93 
 
 
423 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  28.93 
 
 
405 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.89 
 
 
462 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  34.65 
 
 
457 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
455 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
497 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
489 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  30.61 
 
 
401 aa  144  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
489 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  37.8 
 
 
466 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  38.57 
 
 
420 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>