More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1710 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  100 
 
 
394 aa  798    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
448 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  39.28 
 
 
424 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  39.37 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 
459 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
442 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  50.22 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  50.47 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.95 
 
 
397 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  48.56 
 
 
403 aa  206  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.43 
 
 
397 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.91 
 
 
402 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  37.37 
 
 
410 aa  204  2e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
397 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
397 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
397 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  31.75 
 
 
451 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
397 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  44.64 
 
 
434 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.25 
 
 
397 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  34.52 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.53 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.24 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.69 
 
 
397 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  33.75 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.82 
 
 
399 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.02 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.57 
 
 
402 aa  193  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.21 
 
 
400 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.21 
 
 
400 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.29 
 
 
465 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.83 
 
 
400 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.39 
 
 
402 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
584 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.63 
 
 
404 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.76 
 
 
473 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.81 
 
 
398 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
492 aa  186  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.58 
 
 
450 aa  186  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
454 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  29.81 
 
 
436 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  42.73 
 
 
471 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  43.63 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  45.41 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0691  poly(A) polymerase family protein  41.07 
 
 
425 aa  171  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 
464 aa  169  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 
487 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 
484 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.72 
 
 
467 aa  166  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  27.29 
 
 
427 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 
552 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
490 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 
499 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.37 
 
 
427 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
490 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  38.05 
 
 
495 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  44.29 
 
 
583 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  42.47 
 
 
410 aa  157  3e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 
491 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 
502 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 
483 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.57 
 
 
485 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  38.78 
 
 
462 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  37.55 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  29.87 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  38.26 
 
 
391 aa  153  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  32.41 
 
 
491 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3561  poly(A) polymerase  37.65 
 
 
550 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876731  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  36.28 
 
 
523 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  32.41 
 
 
467 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  36.02 
 
 
423 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 
462 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  34.77 
 
 
462 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  26.88 
 
 
437 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  36.12 
 
 
480 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 
508 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  30.58 
 
 
389 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  36.75 
 
 
435 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  39.32 
 
 
388 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  35.59 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2991  poly(A) polymerase  38.4 
 
 
540 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.406392  normal  0.256154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  32.99 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  36.44 
 
 
439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  40.2 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  36.29 
 
 
463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  33.69 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  36.96 
 
 
457 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
496 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  35.27 
 
 
471 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  35.9 
 
 
438 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  36 
 
 
483 aa  146  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  38.67 
 
 
467 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  35.9 
 
 
435 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  33.69 
 
 
467 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  32.28 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.32 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  35.9 
 
 
435 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  33.69 
 
 
467 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>