More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0691 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0691  poly(A) polymerase family protein  100 
 
 		 425 aa  869    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  38.6 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  34.92 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  38.05 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  38.24 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  43.68 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  43.68 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  43.68 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  43.68 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  42.91 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  42.91 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  39.08 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  38.85 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1618  poly(A) polymerase  38.14 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000408315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  43.07 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  48.1 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  35.29 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  35.53 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  35.29 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  35.29 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  35.29 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1515  poly(A) polymerase  39.79 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0267914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  45.31 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  35.16 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  32.62 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  43.15 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0390  poly(A) polymerase  37.9 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0179793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1795  poly(A) polymerase  37.9 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.649421  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  35.98 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05829  poly(A) polymerase (PAP) (Plasmid copy number protein)  38.76 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.832163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  42.08 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  34.34 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  34.34 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  34.77 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  38.16 
 
 		 467 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  38.16 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  39 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3250  polyA polymerase  32.72 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  41.83 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  32.61 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1008  poly(A) polymerase I  34.94 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000170509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3340  poly(A) polymerase I  34.94 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.71757e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  34.53 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  42.64 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3470  poly(A) polymerase I  34.94 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0582  poly(A) polymerase  32.77 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  32.87 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  32.93 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0171  poly(A) polymerase  41.15 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  31.73 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2607  poly(A) polymerase (plasmid copy number protein)  33.67 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000156252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  45.27 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  44.86 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0195  polynucleotide adenyltransferase  41.15 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  33.84 
 
 		 505 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1973  poly(A) polymerase  35.12 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  39.71 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  33.74 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0292  poly(A) polymerase  39.26 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  43.57 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03448  nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  41.02 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2991  poly(A) polymerase  32.55 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2418  poly(A) polymerase  32.55 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2188  poly(A) polymerase  35.78 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.891467  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0683  poly(A) polymerase I  34.63 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000190798  normal  0.448758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  33.5 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4310  polyA polymerase  33.82 
 
 		 474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3172  poly(A) polymerase  44.58 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000541948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4014  poly(A) polymerase  32.47 
 
 		 484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0546071  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3130  poly(A) polymerase  41.13 
 
 		 494 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  37.86 
 
 		 496 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2509  poly(A) polymerase  35 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0562  poly(A) polymerase  38.97 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057959  hitchhiker  0.000000459725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002563  poly(A) polymerase  40.62 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000329901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0696  poly(A) polymerase  42.98 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000117677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1769  poly(A) polymerase  35.5 
 
 		 535 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  40.74 
 
 		 535 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1131  poly(A) polymerase  41.13 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0882  poly(A) polymerase  35.89 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  43.09 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  43.09 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  43.09 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03548  poly(A) polymerase I  40.08 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.339485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  43.09 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2627  poly(A) polymerase  39.61 
 
 		 512 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1314  polyA polymerase  39.2 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3304  poly(A) polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2320  polyA polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2199  poly(A) polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3314  polyA polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1092  polyA polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0507  polyA polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3271  poly(A) polymerase  39.2 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.264957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>