More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1260 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  79.85 
 
 
397 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  80.1 
 
 
397 aa  675    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  80.1 
 
 
397 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  80.1 
 
 
397 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  79.6 
 
 
397 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  79.09 
 
 
397 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  80.1 
 
 
397 aa  675    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
397 aa  815    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  80.1 
 
 
397 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  79.85 
 
 
397 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  79.6 
 
 
397 aa  668    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  50.63 
 
 
404 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  51.4 
 
 
404 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.51 
 
 
402 aa  315  6e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.51 
 
 
402 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.71 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.75 
 
 
403 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  40.15 
 
 
401 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.35 
 
 
398 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.59 
 
 
400 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.59 
 
 
400 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.43 
 
 
400 aa  258  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.46 
 
 
399 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.64 
 
 
448 aa  200  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  35.86 
 
 
394 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  29.61 
 
 
422 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  44.4 
 
 
434 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  29.37 
 
 
424 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  30.73 
 
 
451 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
459 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  30 
 
 
436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  37.59 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  31.23 
 
 
407 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.98 
 
 
473 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  43.28 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
492 aa  173  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  43.88 
 
 
436 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  36.92 
 
 
410 aa  170  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.15 
 
 
464 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  32.76 
 
 
471 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
454 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.79 
 
 
464 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.48 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 
465 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  40.47 
 
 
490 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
584 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 
484 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  31.37 
 
 
420 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 
583 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  27.29 
 
 
427 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  41.92 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  32.68 
 
 
406 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  38.91 
 
 
552 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.86 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 
473 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 
525 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  38.86 
 
 
467 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  39.15 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  36.71 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  36.99 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.41 
 
 
422 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  37.5 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  37.56 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  42.27 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  37.8 
 
 
418 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  37.37 
 
 
391 aa  138  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  39.41 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  40.39 
 
 
380 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.1 
 
 
417 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.17 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  35.94 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.9 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  38 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  39.29 
 
 
510 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.92 
 
 
418 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.61 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
489 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  37.62 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  37.98 
 
 
423 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  38.57 
 
 
480 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
489 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
455 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  36.73 
 
 
523 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  37.98 
 
 
405 aa  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  37.02 
 
 
415 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  32.57 
 
 
424 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  36.77 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  39.13 
 
 
485 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.55 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.54 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.12 
 
 
423 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  35.48 
 
 
419 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
499 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
491 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>