More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2407 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  100 
 
 
471 aa  897    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
448 aa  257  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  32.17 
 
 
422 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  32.17 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
464 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  47.03 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  45.83 
 
 
436 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
459 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  45.6 
 
 
436 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  32.89 
 
 
448 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  44.04 
 
 
436 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
442 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.03 
 
 
401 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.44 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.38 
 
 
404 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
450 aa  192  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  34.98 
 
 
451 aa  192  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.83 
 
 
403 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 
454 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.64 
 
 
404 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  26.42 
 
 
410 aa  187  3e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
584 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 
465 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
492 aa  183  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  54.11 
 
 
407 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
484 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  42.73 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.42 
 
 
402 aa  177  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  37.74 
 
 
410 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.57 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
500 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
490 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  39.56 
 
 
488 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.96 
 
 
397 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.79 
 
 
397 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  32.64 
 
 
475 aa  171  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
552 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
473 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
507 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.58 
 
 
397 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.58 
 
 
397 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.58 
 
 
397 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.58 
 
 
397 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.21 
 
 
402 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  33.65 
 
 
427 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.83 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.34 
 
 
397 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.66 
 
 
397 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.43 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  39.53 
 
 
483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  36.84 
 
 
420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.34 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.74 
 
 
402 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.03 
 
 
499 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 
483 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
473 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
502 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
491 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  38.44 
 
 
483 aa  156  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
583 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  32.41 
 
 
471 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  30.79 
 
 
471 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.74 
 
 
400 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.74 
 
 
400 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  39.79 
 
 
525 aa  153  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  31.64 
 
 
523 aa  153  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
496 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  38.36 
 
 
510 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  39.15 
 
 
399 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  27.37 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  38.87 
 
 
479 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
508 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
486 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  38.13 
 
 
485 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  43.06 
 
 
466 aa  142  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  42.01 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.84 
 
 
427 aa  140  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1467  poly(A) polymerase  36.1 
 
 
546 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1024  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
457 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.53 
 
 
467 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  36.91 
 
 
423 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  35.76 
 
 
462 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  33.41 
 
 
480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  37.5 
 
 
465 aa  136  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  45.57 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3020  putative polynucleotide adenylyltransferase protein  36.23 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.03108  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  36.48 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2914  poly(A) polymerase  36.84 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
483 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2777  Poly(A) polymerase, PcnB  36.84 
 
 
509 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0701742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>