More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2891 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 		 386 aa  773    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  57.52 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  55.21 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  56.2 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  56.2 
 
 		 380 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  54.19 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  48.7 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  42.29 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  43.6 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  40.64 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  40.29 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  40.7 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  40.59 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  37.38 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.22 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  40.92 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  39.66 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.52 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  38.71 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  47.15 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  43.8 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  48.94 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  39.68 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  42.23 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  42.28 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  40.94 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  50.18 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  39.69 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  49.08 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.12 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.32 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  38.86 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.4 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  37.81 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  39.59 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  51.95 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  43.17 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  34.94 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  34.9 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  38.04 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  41.22 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  38.64 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  32.06 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.82 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  33.6 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.53 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.21 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.79 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.67 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  38.67 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  33.72 
 
 		 424 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  34.1 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.97 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.6 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.66 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 552 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.66 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.5 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.66 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.18 
 
 		 473 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.66 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  36.32 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  41.95 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.85 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  39.38 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.31 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  37.08 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.95 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  42.51 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.78 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.78 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 499 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.96 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 		 484 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  41.2 
 
 		 480 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  38.82 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 		 490 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  40.89 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  36.33 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  38.1 
 
 		 523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  31.16 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 		 473 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 		 583 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>