More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2789 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  89.81 
 
 
417 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
422 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  63.42 
 
 
420 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  63.16 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  55.88 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  58.14 
 
 
405 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  56.83 
 
 
415 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  55.8 
 
 
409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  52.31 
 
 
417 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  44.58 
 
 
417 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  43.6 
 
 
419 aa  305  8.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  47.24 
 
 
418 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  41.35 
 
 
417 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  45.28 
 
 
417 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  44.66 
 
 
401 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.98 
 
 
418 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  47.23 
 
 
418 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  45.78 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  45.28 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  43.8 
 
 
400 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  44.18 
 
 
418 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  43.41 
 
 
389 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  46.04 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  44.27 
 
 
525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  42.58 
 
 
398 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.3 
 
 
421 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.95 
 
 
419 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  39.76 
 
 
386 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  44.96 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.53 
 
 
428 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  33.33 
 
 
396 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  35.55 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  53.73 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  41.29 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  44.12 
 
 
380 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.54 
 
 
420 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  44.39 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  43.12 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  38.73 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  45.1 
 
 
380 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  44.48 
 
 
418 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  50.51 
 
 
417 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  33.68 
 
 
401 aa  228  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  34.28 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  40.88 
 
 
412 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.06 
 
 
427 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
450 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  31.54 
 
 
451 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.01 
 
 
397 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.37 
 
 
397 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
465 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.37 
 
 
397 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.88 
 
 
397 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.88 
 
 
397 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.88 
 
 
397 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.88 
 
 
397 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.63 
 
 
397 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.24 
 
 
399 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  31.6 
 
 
410 aa  137  4e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  26.63 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.17 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.46 
 
 
397 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  28.5 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.7 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.2 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  42.66 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.15 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  37.73 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  37.5 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.75 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.92 
 
 
401 aa  126  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.17 
 
 
398 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.78 
 
 
402 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.87 
 
 
404 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
459 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  34.31 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  35.21 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.44 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  36.22 
 
 
436 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  34.47 
 
 
436 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.55 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  30.92 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  34.26 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.44 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.44 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.79 
 
 
583 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 
499 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
490 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
584 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
464 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
502 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
525 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  28.95 
 
 
427 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  31.32 
 
 
523 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  26.15 
 
 
437 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>