More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0081 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  100 
 
 		 379 aa  744    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  54.19 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  58.27 
 
 		 380 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  57.22 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  57.74 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  56.51 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  49.58 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  44.88 
 
 		 420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  41.56 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  41.93 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  44.53 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  40.83 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  42.61 
 
 		 405 aa  252  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  43 
 
 		 409 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  42.05 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  40.94 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  51.34 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  45.12 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.55 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.29 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  42.47 
 
 		 417 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  51.69 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  51.85 
 
 		 428 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  39.23 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  46.61 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  51.21 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  55.06 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  44.91 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.89 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  43.53 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  47.22 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  42.45 
 
 		 398 aa  215  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  44.06 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  51.57 
 
 		 417 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  48.47 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  42.71 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  41.1 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  35.62 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  46.44 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  45.4 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  48.46 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  35.14 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  47.57 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  33.33 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  48.26 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.7 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  44.64 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  37.82 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  34.45 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.4 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.65 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  38 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  37.75 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.09 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.99 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.46 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  43.14 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.09 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 436 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  40.93 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.35 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 		 552 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.56 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.82 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.21 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.63 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.82 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 464 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.43 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 436 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.62 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.64 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.91 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  39.3 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.87 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.87 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.44 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  37.05 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  40.62 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.22 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.27 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 483 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 502 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 499 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  33.21 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>