More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2952 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
406 aa  775    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  53.98 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  52.81 
 
 
417 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  55.44 
 
 
418 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  53.61 
 
 
417 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  50.37 
 
 
419 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  51.13 
 
 
417 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  53.85 
 
 
418 aa  339  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  50.26 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  54.17 
 
 
418 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  54.52 
 
 
417 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  49.5 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  48.44 
 
 
424 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  45.95 
 
 
415 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  48.96 
 
 
428 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  44.64 
 
 
417 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  47.46 
 
 
417 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  45.5 
 
 
423 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  45.96 
 
 
405 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  44.78 
 
 
409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  43.15 
 
 
417 aa  279  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  48.83 
 
 
412 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.78 
 
 
422 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  43.97 
 
 
420 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  44.86 
 
 
419 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  41.98 
 
 
419 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  47.24 
 
 
401 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  42.44 
 
 
417 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  44.36 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  40 
 
 
417 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  47.35 
 
 
382 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  43.65 
 
 
400 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  47.27 
 
 
388 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  45.58 
 
 
389 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  45.83 
 
 
398 aa  239  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  45.81 
 
 
379 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  47.11 
 
 
380 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  34.5 
 
 
391 aa  224  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  46.3 
 
 
380 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  43.07 
 
 
525 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  31.9 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  32.73 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  46.17 
 
 
380 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  34.04 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.07 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.31 
 
 
427 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.9 
 
 
397 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.08 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.02 
 
 
404 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.22 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  34.17 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  29.9 
 
 
448 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  42.11 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  34.2 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.51 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.84 
 
 
398 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.06 
 
 
402 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.5 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.51 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.36 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.87 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.87 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.87 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.77 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.87 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  30.65 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  33.77 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
490 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.87 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.55 
 
 
397 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.97 
 
 
397 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 
450 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.93 
 
 
465 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
459 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.3 
 
 
397 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.2 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
448 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
484 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  35.86 
 
 
451 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 
473 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 
552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  40 
 
 
434 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.7 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.7 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  37.76 
 
 
455 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
583 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3131  poly(A) polymerase  37.5 
 
 
480 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000115831  normal  0.0863023 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 
492 aa  110  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
502 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  37.07 
 
 
421 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  33.57 
 
 
437 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 
490 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0696  poly(A) polymerase  35.46 
 
 
434 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000117677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  33.22 
 
 
437 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  38.36 
 
 
471 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  33.22 
 
 
454 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>